Każde oprogramowanie domyślnie obsługuje wiele rozszerzeń plików. ABBYY FineReader obsługuje co najmniej 1 różnych rozszerzeń plików. Podstawowe pliki, które wspiera ABBYY FineReader to pliki .FBT. Nie zawsze wszysztkie wymienione na liście rozszerzenia wykorzysywane są jednak do zapisu efektów pracy w ABBYY FineReader. Bardzo często, pliki z takimi rozszerzeniami wykorzystywane są jako pliki źródłowe danych wykorzystywanych przez ABBYY FineReader.
ABBYY FineReader może być wykorzystany do konwersji formatów plików, pomiędzy rozszerzeniami wymienionymi poniżej. Możesz otworzyć za pośrednictwem ABBYY FineReader plik posiadający jedno z poniższych rozszerzeń i spróbować zapisać go w innym rozszerzeniu, również obsługiwanym przez ABBYY FineReader.