Każde oprogramowanie domyślnie obsługuje wiele rozszerzeń plików. Ad-Aware PRO obsługuje co najmniej 6 różnych rozszerzeń plików. Podstawowe pliki, które wspiera Ad-Aware PRO to pliki .BCKP. Nie zawsze wszysztkie wymienione na liście rozszerzenia wykorzysywane są jednak do zapisu efektów pracy w Ad-Aware PRO. Bardzo często, pliki z takimi rozszerzeniami wykorzystywane są jako pliki źródłowe danych wykorzystywanych przez Ad-Aware PRO.
Ad-Aware PRO może być wykorzystany do konwersji formatów plików, pomiędzy rozszerzeniami wymienionymi poniżej. Możesz otworzyć za pośrednictwem Ad-Aware PRO plik posiadający jedno z poniższych rozszerzeń i spróbować zapisać go w innym rozszerzeniu, również obsługiwanym przez Ad-Aware PRO.