Każde oprogramowanie domyślnie obsługuje wiele rozszerzeń plików. Adobe Mocha for Adobe After Effects obsługuje co najmniej 11 różnych rozszerzeń plików. Podstawowe pliki, które wspiera Adobe Mocha for Adobe After Effects to pliki .M2S. Nie zawsze wszysztkie wymienione na liście rozszerzenia wykorzysywane są jednak do zapisu efektów pracy w Adobe Mocha for Adobe After Effects. Bardzo często, pliki z takimi rozszerzeniami wykorzystywane są jako pliki źródłowe danych wykorzystywanych przez Adobe Mocha for Adobe After Effects.
Adobe Mocha for Adobe After Effects może być wykorzystany do konwersji formatów plików, pomiędzy rozszerzeniami wymienionymi poniżej. Możesz otworzyć za pośrednictwem Adobe Mocha for Adobe After Effects plik posiadający jedno z poniższych rozszerzeń i spróbować zapisać go w innym rozszerzeniu, również obsługiwanym przez Adobe Mocha for Adobe After Effects.