Każde oprogramowanie domyślnie obsługuje wiele rozszerzeń plików. Atomic Combat obsługuje co najmniej 1 różnych rozszerzeń plików. Podstawowe pliki, które wspiera Atomic Combat to pliki .MATO. Nie zawsze wszysztkie wymienione na liście rozszerzenia wykorzysywane są jednak do zapisu efektów pracy w Atomic Combat. Bardzo często, pliki z takimi rozszerzeniami wykorzystywane są jako pliki źródłowe danych wykorzystywanych przez Atomic Combat.
Atomic Combat może być wykorzystany do konwersji formatów plików, pomiędzy rozszerzeniami wymienionymi poniżej. Możesz otworzyć za pośrednictwem Atomic Combat plik posiadający jedno z poniższych rozszerzeń i spróbować zapisać go w innym rozszerzeniu, również obsługiwanym przez Atomic Combat.