Każde oprogramowanie domyślnie obsługuje wiele rozszerzeń plików. BioAnalyst Software obsługuje co najmniej 1 różnych rozszerzeń plików. Podstawowe pliki, które wspiera BioAnalyst Software to pliki .WIFF. Nie zawsze wszysztkie wymienione na liście rozszerzenia wykorzysywane są jednak do zapisu efektów pracy w BioAnalyst Software. Bardzo często, pliki z takimi rozszerzeniami wykorzystywane są jako pliki źródłowe danych wykorzystywanych przez BioAnalyst Software.
BioAnalyst Software może być wykorzystany do konwersji formatów plików, pomiędzy rozszerzeniami wymienionymi poniżej. Możesz otworzyć za pośrednictwem BioAnalyst Software plik posiadający jedno z poniższych rozszerzeń i spróbować zapisać go w innym rozszerzeniu, również obsługiwanym przez BioAnalyst Software.