Każde oprogramowanie domyślnie obsługuje wiele rozszerzeń plików. BodyPaint 3D obsługuje co najmniej 1 różnych rozszerzeń plików. Podstawowe pliki, które wspiera BodyPaint 3D to pliki .B3D. Nie zawsze wszysztkie wymienione na liście rozszerzenia wykorzysywane są jednak do zapisu efektów pracy w BodyPaint 3D. Bardzo często, pliki z takimi rozszerzeniami wykorzystywane są jako pliki źródłowe danych wykorzystywanych przez BodyPaint 3D.
BodyPaint 3D może być wykorzystany do konwersji formatów plików, pomiędzy rozszerzeniami wymienionymi poniżej. Możesz otworzyć za pośrednictwem BodyPaint 3D plik posiadający jedno z poniższych rozszerzeń i spróbować zapisać go w innym rozszerzeniu, również obsługiwanym przez BodyPaint 3D.