Każde oprogramowanie domyślnie obsługuje wiele rozszerzeń plików. CocoModX obsługuje co najmniej 14 różnych rozszerzeń plików. Podstawowe pliki, które wspiera CocoModX to pliki .PTM. Nie zawsze wszysztkie wymienione na liście rozszerzenia wykorzysywane są jednak do zapisu efektów pracy w CocoModX. Bardzo często, pliki z takimi rozszerzeniami wykorzystywane są jako pliki źródłowe danych wykorzystywanych przez CocoModX.
CocoModX może być wykorzystany do konwersji formatów plików, pomiędzy rozszerzeniami wymienionymi poniżej. Możesz otworzyć za pośrednictwem CocoModX plik posiadający jedno z poniższych rozszerzeń i spróbować zapisać go w innym rozszerzeniu, również obsługiwanym przez CocoModX.