Każde oprogramowanie domyślnie obsługuje wiele rozszerzeń plików. Commandos 3 obsługuje co najmniej 1 różnych rozszerzeń plików. Podstawowe pliki, które wspiera Commandos 3 to pliki .PCK. Nie zawsze wszysztkie wymienione na liście rozszerzenia wykorzysywane są jednak do zapisu efektów pracy w Commandos 3. Bardzo często, pliki z takimi rozszerzeniami wykorzystywane są jako pliki źródłowe danych wykorzystywanych przez Commandos 3.
Commandos 3 może być wykorzystany do konwersji formatów plików, pomiędzy rozszerzeniami wymienionymi poniżej. Możesz otworzyć za pośrednictwem Commandos 3 plik posiadający jedno z poniższych rozszerzeń i spróbować zapisać go w innym rozszerzeniu, również obsługiwanym przez Commandos 3.