Każde oprogramowanie domyślnie obsługuje wiele rozszerzeń plików. Daring Fireball Markdown obsługuje co najmniej 2 różnych rozszerzeń plików. Podstawowe pliki, które wspiera Daring Fireball Markdown to pliki .MD. Nie zawsze wszysztkie wymienione na liście rozszerzenia wykorzysywane są jednak do zapisu efektów pracy w Daring Fireball Markdown. Bardzo często, pliki z takimi rozszerzeniami wykorzystywane są jako pliki źródłowe danych wykorzystywanych przez Daring Fireball Markdown.
Daring Fireball Markdown może być wykorzystany do konwersji formatów plików, pomiędzy rozszerzeniami wymienionymi poniżej. Możesz otworzyć za pośrednictwem Daring Fireball Markdown plik posiadający jedno z poniższych rozszerzeń i spróbować zapisać go w innym rozszerzeniu, również obsługiwanym przez Daring Fireball Markdown.