Każde oprogramowanie domyślnie obsługuje wiele rozszerzeń plików. Digidesign Pro Tools LE obsługuje co najmniej 4 różnych rozszerzeń plików. Podstawowe pliki, które wspiera Digidesign Pro Tools LE to pliki .PT4. Nie zawsze wszysztkie wymienione na liście rozszerzenia wykorzysywane są jednak do zapisu efektów pracy w Digidesign Pro Tools LE. Bardzo często, pliki z takimi rozszerzeniami wykorzystywane są jako pliki źródłowe danych wykorzystywanych przez Digidesign Pro Tools LE.
Digidesign Pro Tools LE może być wykorzystany do konwersji formatów plików, pomiędzy rozszerzeniami wymienionymi poniżej. Możesz otworzyć za pośrednictwem Digidesign Pro Tools LE plik posiadający jedno z poniższych rozszerzeń i spróbować zapisać go w innym rozszerzeniu, również obsługiwanym przez Digidesign Pro Tools LE.