Każde oprogramowanie domyślnie obsługuje wiele rozszerzeń plików. E-Prime obsługuje co najmniej 4 różnych rozszerzeń plików. Podstawowe pliki, które wspiera E-Prime to pliki .ES. Nie zawsze wszysztkie wymienione na liście rozszerzenia wykorzysywane są jednak do zapisu efektów pracy w E-Prime. Bardzo często, pliki z takimi rozszerzeniami wykorzystywane są jako pliki źródłowe danych wykorzystywanych przez E-Prime.
E-Prime może być wykorzystany do konwersji formatów plików, pomiędzy rozszerzeniami wymienionymi poniżej. Możesz otworzyć za pośrednictwem E-Prime plik posiadający jedno z poniższych rozszerzeń i spróbować zapisać go w innym rozszerzeniu, również obsługiwanym przez E-Prime.