Każde oprogramowanie domyślnie obsługuje wiele rozszerzeń plików. EMS SQL Manager for MySQL obsługuje co najmniej 1 różnych rozszerzeń plików. Podstawowe pliki, które wspiera EMS SQL Manager for MySQL to pliki .ZSQL. Nie zawsze wszysztkie wymienione na liście rozszerzenia wykorzysywane są jednak do zapisu efektów pracy w EMS SQL Manager for MySQL. Bardzo często, pliki z takimi rozszerzeniami wykorzystywane są jako pliki źródłowe danych wykorzystywanych przez EMS SQL Manager for MySQL.
EMS SQL Manager for MySQL może być wykorzystany do konwersji formatów plików, pomiędzy rozszerzeniami wymienionymi poniżej. Możesz otworzyć za pośrednictwem EMS SQL Manager for MySQL plik posiadający jedno z poniższych rozszerzeń i spróbować zapisać go w innym rozszerzeniu, również obsługiwanym przez EMS SQL Manager for MySQL.