Każde oprogramowanie domyślnie obsługuje wiele rozszerzeń plików. eMusic/J obsługuje co najmniej 2 różnych rozszerzeń plików. Podstawowe pliki, które wspiera eMusic/J to pliki .EMP. Nie zawsze wszysztkie wymienione na liście rozszerzenia wykorzysywane są jednak do zapisu efektów pracy w eMusic/J. Bardzo często, pliki z takimi rozszerzeniami wykorzystywane są jako pliki źródłowe danych wykorzystywanych przez eMusic/J.
eMusic/J może być wykorzystany do konwersji formatów plików, pomiędzy rozszerzeniami wymienionymi poniżej. Możesz otworzyć za pośrednictwem eMusic/J plik posiadający jedno z poniższych rozszerzeń i spróbować zapisać go w innym rozszerzeniu, również obsługiwanym przez eMusic/J.