Każde oprogramowanie domyślnie obsługuje wiele rozszerzeń plików. exe4j obsługuje co najmniej 1 różnych rozszerzeń plików. Podstawowe pliki, które wspiera exe4j to pliki .EXE4J. Nie zawsze wszysztkie wymienione na liście rozszerzenia wykorzysywane są jednak do zapisu efektów pracy w exe4j. Bardzo często, pliki z takimi rozszerzeniami wykorzystywane są jako pliki źródłowe danych wykorzystywanych przez exe4j.
exe4j może być wykorzystany do konwersji formatów plików, pomiędzy rozszerzeniami wymienionymi poniżej. Możesz otworzyć za pośrednictwem exe4j plik posiadający jedno z poniższych rozszerzeń i spróbować zapisać go w innym rozszerzeniu, również obsługiwanym przez exe4j.