Każde oprogramowanie domyślnie obsługuje wiele rozszerzeń plików. Flow Charting obsługuje co najmniej 2 różnych rozszerzeń plików. Podstawowe pliki, które wspiera Flow Charting to pliki .GFC. Nie zawsze wszysztkie wymienione na liście rozszerzenia wykorzysywane są jednak do zapisu efektów pracy w Flow Charting. Bardzo często, pliki z takimi rozszerzeniami wykorzystywane są jako pliki źródłowe danych wykorzystywanych przez Flow Charting.
Flow Charting może być wykorzystany do konwersji formatów plików, pomiędzy rozszerzeniami wymienionymi poniżej. Możesz otworzyć za pośrednictwem Flow Charting plik posiadający jedno z poniższych rozszerzeń i spróbować zapisać go w innym rozszerzeniu, również obsługiwanym przez Flow Charting.