Każde oprogramowanie domyślnie obsługuje wiele rozszerzeń plików. GBA4iOS obsługuje co najmniej 2 różnych rozszerzeń plików. Podstawowe pliki, które wspiera GBA4iOS to pliki .GBCSKIN. Nie zawsze wszysztkie wymienione na liście rozszerzenia wykorzysywane są jednak do zapisu efektów pracy w GBA4iOS. Bardzo często, pliki z takimi rozszerzeniami wykorzystywane są jako pliki źródłowe danych wykorzystywanych przez GBA4iOS.
GBA4iOS może być wykorzystany do konwersji formatów plików, pomiędzy rozszerzeniami wymienionymi poniżej. Możesz otworzyć za pośrednictwem GBA4iOS plik posiadający jedno z poniższych rozszerzeń i spróbować zapisać go w innym rozszerzeniu, również obsługiwanym przez GBA4iOS.