Każde oprogramowanie domyślnie obsługuje wiele rozszerzeń plików. Halo Custom Edition obsługuje co najmniej 1 różnych rozszerzeń plików. Podstawowe pliki, które wspiera Halo Custom Edition to pliki .KSML. Nie zawsze wszysztkie wymienione na liście rozszerzenia wykorzysywane są jednak do zapisu efektów pracy w Halo Custom Edition. Bardzo często, pliki z takimi rozszerzeniami wykorzystywane są jako pliki źródłowe danych wykorzystywanych przez Halo Custom Edition.
Halo Custom Edition może być wykorzystany do konwersji formatów plików, pomiędzy rozszerzeniami wymienionymi poniżej. Możesz otworzyć za pośrednictwem Halo Custom Edition plik posiadający jedno z poniższych rozszerzeń i spróbować zapisać go w innym rozszerzeniu, również obsługiwanym przez Halo Custom Edition.