Każde oprogramowanie domyślnie obsługuje wiele rozszerzeń plików. Handy Emulator obsługuje co najmniej 1 różnych rozszerzeń plików. Podstawowe pliki, które wspiera Handy Emulator to pliki .LNX. Nie zawsze wszysztkie wymienione na liście rozszerzenia wykorzysywane są jednak do zapisu efektów pracy w Handy Emulator. Bardzo często, pliki z takimi rozszerzeniami wykorzystywane są jako pliki źródłowe danych wykorzystywanych przez Handy Emulator.
Handy Emulator może być wykorzystany do konwersji formatów plików, pomiędzy rozszerzeniami wymienionymi poniżej. Możesz otworzyć za pośrednictwem Handy Emulator plik posiadający jedno z poniższych rozszerzeń i spróbować zapisać go w innym rozszerzeniu, również obsługiwanym przez Handy Emulator.