Każde oprogramowanie domyślnie obsługuje wiele rozszerzeń plików. iGrafx FlowCharter obsługuje co najmniej 2 różnych rozszerzeń plików. Podstawowe pliki, które wspiera iGrafx FlowCharter to pliki .FTM. Nie zawsze wszysztkie wymienione na liście rozszerzenia wykorzysywane są jednak do zapisu efektów pracy w iGrafx FlowCharter. Bardzo często, pliki z takimi rozszerzeniami wykorzystywane są jako pliki źródłowe danych wykorzystywanych przez iGrafx FlowCharter.
iGrafx FlowCharter może być wykorzystany do konwersji formatów plików, pomiędzy rozszerzeniami wymienionymi poniżej. Możesz otworzyć za pośrednictwem iGrafx FlowCharter plik posiadający jedno z poniższych rozszerzeń i spróbować zapisać go w innym rozszerzeniu, również obsługiwanym przez iGrafx FlowCharter.