Każde oprogramowanie domyślnie obsługuje wiele rozszerzeń plików. Infected Windows systems obsługuje co najmniej 1 różnych rozszerzeń plików. Podstawowe pliki, które wspiera Infected Windows systems to pliki .QIT. Nie zawsze wszysztkie wymienione na liście rozszerzenia wykorzysywane są jednak do zapisu efektów pracy w Infected Windows systems. Bardzo często, pliki z takimi rozszerzeniami wykorzystywane są jako pliki źródłowe danych wykorzystywanych przez Infected Windows systems.
Infected Windows systems może być wykorzystany do konwersji formatów plików, pomiędzy rozszerzeniami wymienionymi poniżej. Możesz otworzyć za pośrednictwem Infected Windows systems plik posiadający jedno z poniższych rozszerzeń i spróbować zapisać go w innym rozszerzeniu, również obsługiwanym przez Infected Windows systems.