Każde oprogramowanie domyślnie obsługuje wiele rozszerzeń plików. iPhone Configuration Utility obsługuje co najmniej 4 różnych rozszerzeń plików. Podstawowe pliki, które wspiera iPhone Configuration Utility to pliki .MOBILECONFIG. Nie zawsze wszysztkie wymienione na liście rozszerzenia wykorzysywane są jednak do zapisu efektów pracy w iPhone Configuration Utility. Bardzo często, pliki z takimi rozszerzeniami wykorzystywane są jako pliki źródłowe danych wykorzystywanych przez iPhone Configuration Utility.
iPhone Configuration Utility może być wykorzystany do konwersji formatów plików, pomiędzy rozszerzeniami wymienionymi poniżej. Możesz otworzyć za pośrednictwem iPhone Configuration Utility plik posiadający jedno z poniższych rozszerzeń i spróbować zapisać go w innym rozszerzeniu, również obsługiwanym przez iPhone Configuration Utility.