Każde oprogramowanie domyślnie obsługuje wiele rozszerzeń plików. Kindle Collection Manager obsługuje co najmniej 1 różnych rozszerzeń plików. Podstawowe pliki, które wspiera Kindle Collection Manager to pliki .AZW2. Nie zawsze wszysztkie wymienione na liście rozszerzenia wykorzysywane są jednak do zapisu efektów pracy w Kindle Collection Manager. Bardzo często, pliki z takimi rozszerzeniami wykorzystywane są jako pliki źródłowe danych wykorzystywanych przez Kindle Collection Manager.
Kindle Collection Manager może być wykorzystany do konwersji formatów plików, pomiędzy rozszerzeniami wymienionymi poniżej. Możesz otworzyć za pośrednictwem Kindle Collection Manager plik posiadający jedno z poniższych rozszerzeń i spróbować zapisać go w innym rozszerzeniu, również obsługiwanym przez Kindle Collection Manager.