Każde oprogramowanie domyślnie obsługuje wiele rozszerzeń plików. MadTracker 2 obsługuje co najmniej 1 różnych rozszerzeń plików. Podstawowe pliki, które wspiera MadTracker 2 to pliki .MT2. Nie zawsze wszysztkie wymienione na liście rozszerzenia wykorzysywane są jednak do zapisu efektów pracy w MadTracker 2. Bardzo często, pliki z takimi rozszerzeniami wykorzystywane są jako pliki źródłowe danych wykorzystywanych przez MadTracker 2.
MadTracker 2 może być wykorzystany do konwersji formatów plików, pomiędzy rozszerzeniami wymienionymi poniżej. Możesz otworzyć za pośrednictwem MadTracker 2 plik posiadający jedno z poniższych rozszerzeń i spróbować zapisać go w innym rozszerzeniu, również obsługiwanym przez MadTracker 2.