Każde oprogramowanie domyślnie obsługuje wiele rozszerzeń plików. Magic: The Gathering Online obsługuje co najmniej 1 różnych rozszerzeń plików. Podstawowe pliki, które wspiera Magic: The Gathering Online to pliki .DEK. Nie zawsze wszysztkie wymienione na liście rozszerzenia wykorzysywane są jednak do zapisu efektów pracy w Magic: The Gathering Online. Bardzo często, pliki z takimi rozszerzeniami wykorzystywane są jako pliki źródłowe danych wykorzystywanych przez Magic: The Gathering Online.
Magic: The Gathering Online może być wykorzystany do konwersji formatów plików, pomiędzy rozszerzeniami wymienionymi poniżej. Możesz otworzyć za pośrednictwem Magic: The Gathering Online plik posiadający jedno z poniższych rozszerzeń i spróbować zapisać go w innym rozszerzeniu, również obsługiwanym przez Magic: The Gathering Online.