Każde oprogramowanie domyślnie obsługuje wiele rozszerzeń plików. Manga Creator obsługuje co najmniej 3 różnych rozszerzeń plików. Podstawowe pliki, które wspiera Manga Creator to pliki .CBT. Nie zawsze wszysztkie wymienione na liście rozszerzenia wykorzysywane są jednak do zapisu efektów pracy w Manga Creator. Bardzo często, pliki z takimi rozszerzeniami wykorzystywane są jako pliki źródłowe danych wykorzystywanych przez Manga Creator.
Manga Creator może być wykorzystany do konwersji formatów plików, pomiędzy rozszerzeniami wymienionymi poniżej. Możesz otworzyć za pośrednictwem Manga Creator plik posiadający jedno z poniższych rozszerzeń i spróbować zapisać go w innym rozszerzeniu, również obsługiwanym przez Manga Creator.