Każde oprogramowanie domyślnie obsługuje wiele rozszerzeń plików. Microsoft Clip Organizer obsługuje co najmniej 1 różnych rozszerzeń plików. Podstawowe pliki, które wspiera Microsoft Clip Organizer to pliki .MPF. Nie zawsze wszysztkie wymienione na liście rozszerzenia wykorzysywane są jednak do zapisu efektów pracy w Microsoft Clip Organizer. Bardzo często, pliki z takimi rozszerzeniami wykorzystywane są jako pliki źródłowe danych wykorzystywanych przez Microsoft Clip Organizer.
Microsoft Clip Organizer może być wykorzystany do konwersji formatów plików, pomiędzy rozszerzeniami wymienionymi poniżej. Możesz otworzyć za pośrednictwem Microsoft Clip Organizer plik posiadający jedno z poniższych rozszerzeń i spróbować zapisać go w innym rozszerzeniu, również obsługiwanym przez Microsoft Clip Organizer.