Każde oprogramowanie domyślnie obsługuje wiele rozszerzeń plików. Midori obsługuje co najmniej 1 różnych rozszerzeń plików. Podstawowe pliki, które wspiera Midori to pliki .XBEL. Nie zawsze wszysztkie wymienione na liście rozszerzenia wykorzysywane są jednak do zapisu efektów pracy w Midori. Bardzo często, pliki z takimi rozszerzeniami wykorzystywane są jako pliki źródłowe danych wykorzystywanych przez Midori.
Midori może być wykorzystany do konwersji formatów plików, pomiędzy rozszerzeniami wymienionymi poniżej. Możesz otworzyć za pośrednictwem Midori plik posiadający jedno z poniższych rozszerzeń i spróbować zapisać go w innym rozszerzeniu, również obsługiwanym przez Midori.