Każde oprogramowanie domyślnie obsługuje wiele rozszerzeń plików. MNE Home obsługuje co najmniej 1 różnych rozszerzeń plików. Podstawowe pliki, które wspiera MNE Home to pliki .FIFF. Nie zawsze wszysztkie wymienione na liście rozszerzenia wykorzysywane są jednak do zapisu efektów pracy w MNE Home. Bardzo często, pliki z takimi rozszerzeniami wykorzystywane są jako pliki źródłowe danych wykorzystywanych przez MNE Home.
MNE Home może być wykorzystany do konwersji formatów plików, pomiędzy rozszerzeniami wymienionymi poniżej. Możesz otworzyć za pośrednictwem MNE Home plik posiadający jedno z poniższych rozszerzeń i spróbować zapisać go w innym rozszerzeniu, również obsługiwanym przez MNE Home.