Każde oprogramowanie domyślnie obsługuje wiele rozszerzeń plików. Mudflap obsługuje co najmniej 1 różnych rozszerzeń plików. Podstawowe pliki, które wspiera Mudflap to pliki .WHM. Nie zawsze wszysztkie wymienione na liście rozszerzenia wykorzysywane są jednak do zapisu efektów pracy w Mudflap. Bardzo często, pliki z takimi rozszerzeniami wykorzystywane są jako pliki źródłowe danych wykorzystywanych przez Mudflap.
Mudflap może być wykorzystany do konwersji formatów plików, pomiędzy rozszerzeniami wymienionymi poniżej. Możesz otworzyć za pośrednictwem Mudflap plik posiadający jedno z poniższych rozszerzeń i spróbować zapisać go w innym rozszerzeniu, również obsługiwanym przez Mudflap.