Każde oprogramowanie domyślnie obsługuje wiele rozszerzeń plików. MySQL Enterprise Backup obsługuje co najmniej 5 różnych rozszerzeń plików. Podstawowe pliki, które wspiera MySQL Enterprise Backup to pliki .FRM. Nie zawsze wszysztkie wymienione na liście rozszerzenia wykorzysywane są jednak do zapisu efektów pracy w MySQL Enterprise Backup. Bardzo często, pliki z takimi rozszerzeniami wykorzystywane są jako pliki źródłowe danych wykorzystywanych przez MySQL Enterprise Backup.
MySQL Enterprise Backup może być wykorzystany do konwersji formatów plików, pomiędzy rozszerzeniami wymienionymi poniżej. Możesz otworzyć za pośrednictwem MySQL Enterprise Backup plik posiadający jedno z poniższych rozszerzeń i spróbować zapisać go w innym rozszerzeniu, również obsługiwanym przez MySQL Enterprise Backup.