Każde oprogramowanie domyślnie obsługuje wiele rozszerzeń plików. Orpalis PaperScan obsługuje co najmniej 1 różnych rozszerzeń plików. Podstawowe pliki, które wspiera Orpalis PaperScan to pliki .JBIG2. Nie zawsze wszysztkie wymienione na liście rozszerzenia wykorzysywane są jednak do zapisu efektów pracy w Orpalis PaperScan. Bardzo często, pliki z takimi rozszerzeniami wykorzystywane są jako pliki źródłowe danych wykorzystywanych przez Orpalis PaperScan.
Orpalis PaperScan może być wykorzystany do konwersji formatów plików, pomiędzy rozszerzeniami wymienionymi poniżej. Możesz otworzyć za pośrednictwem Orpalis PaperScan plik posiadający jedno z poniższych rozszerzeń i spróbować zapisać go w innym rozszerzeniu, również obsługiwanym przez Orpalis PaperScan.