Każde oprogramowanie domyślnie obsługuje wiele rozszerzeń plików. PIPE-FLO Professional obsługuje co najmniej 3 różnych rozszerzeń plików. Podstawowe pliki, które wspiera PIPE-FLO Professional to pliki .PIPE. Nie zawsze wszysztkie wymienione na liście rozszerzenia wykorzysywane są jednak do zapisu efektów pracy w PIPE-FLO Professional. Bardzo często, pliki z takimi rozszerzeniami wykorzystywane są jako pliki źródłowe danych wykorzystywanych przez PIPE-FLO Professional.
PIPE-FLO Professional może być wykorzystany do konwersji formatów plików, pomiędzy rozszerzeniami wymienionymi poniżej. Możesz otworzyć za pośrednictwem PIPE-FLO Professional plik posiadający jedno z poniższych rozszerzeń i spróbować zapisać go w innym rozszerzeniu, również obsługiwanym przez PIPE-FLO Professional.