Każde oprogramowanie domyślnie obsługuje wiele rozszerzeń plików. Pretty Good Privacy obsługuje co najmniej 11 różnych rozszerzeń plików. Podstawowe pliki, które wspiera Pretty Good Privacy to pliki .SEC. Nie zawsze wszysztkie wymienione na liście rozszerzenia wykorzysywane są jednak do zapisu efektów pracy w Pretty Good Privacy. Bardzo często, pliki z takimi rozszerzeniami wykorzystywane są jako pliki źródłowe danych wykorzystywanych przez Pretty Good Privacy.
Pretty Good Privacy może być wykorzystany do konwersji formatów plików, pomiędzy rozszerzeniami wymienionymi poniżej. Możesz otworzyć za pośrednictwem Pretty Good Privacy plik posiadający jedno z poniższych rozszerzeń i spróbować zapisać go w innym rozszerzeniu, również obsługiwanym przez Pretty Good Privacy.