Każde oprogramowanie domyślnie obsługuje wiele rozszerzeń plików. Quake 2 obsługuje co najmniej 5 różnych rozszerzeń plików. Podstawowe pliki, które wspiera Quake 2 to pliki .BSP. Nie zawsze wszysztkie wymienione na liście rozszerzenia wykorzysywane są jednak do zapisu efektów pracy w Quake 2. Bardzo często, pliki z takimi rozszerzeniami wykorzystywane są jako pliki źródłowe danych wykorzystywanych przez Quake 2.
Quake 2 może być wykorzystany do konwersji formatów plików, pomiędzy rozszerzeniami wymienionymi poniżej. Możesz otworzyć za pośrednictwem Quake 2 plik posiadający jedno z poniższych rozszerzeń i spróbować zapisać go w innym rozszerzeniu, również obsługiwanym przez Quake 2.