Każde oprogramowanie domyślnie obsługuje wiele rozszerzeń plików. ROT Tool obsługuje co najmniej 1 różnych rozszerzeń plików. Podstawowe pliki, które wspiera ROT Tool to pliki .ROT. Nie zawsze wszysztkie wymienione na liście rozszerzenia wykorzysywane są jednak do zapisu efektów pracy w ROT Tool. Bardzo często, pliki z takimi rozszerzeniami wykorzystywane są jako pliki źródłowe danych wykorzystywanych przez ROT Tool.
ROT Tool może być wykorzystany do konwersji formatów plików, pomiędzy rozszerzeniami wymienionymi poniżej. Możesz otworzyć za pośrednictwem ROT Tool plik posiadający jedno z poniższych rozszerzeń i spróbować zapisać go w innym rozszerzeniu, również obsługiwanym przez ROT Tool.