Każde oprogramowanie domyślnie obsługuje wiele rozszerzeń plików. SE-DesktopApps obsługuje co najmniej 1 różnych rozszerzeń plików. Podstawowe pliki, które wspiera SE-DesktopApps to pliki .OPTIONS. Nie zawsze wszysztkie wymienione na liście rozszerzenia wykorzysywane są jednak do zapisu efektów pracy w SE-DesktopApps. Bardzo często, pliki z takimi rozszerzeniami wykorzystywane są jako pliki źródłowe danych wykorzystywanych przez SE-DesktopApps.
SE-DesktopApps może być wykorzystany do konwersji formatów plików, pomiędzy rozszerzeniami wymienionymi poniżej. Możesz otworzyć za pośrednictwem SE-DesktopApps plik posiadający jedno z poniższych rozszerzeń i spróbować zapisać go w innym rozszerzeniu, również obsługiwanym przez SE-DesktopApps.