Każde oprogramowanie domyślnie obsługuje wiele rozszerzeń plików. SigmaPlot obsługuje co najmniej 2 różnych rozszerzeń plików. Podstawowe pliki, które wspiera SigmaPlot to pliki .JNB. Nie zawsze wszysztkie wymienione na liście rozszerzenia wykorzysywane są jednak do zapisu efektów pracy w SigmaPlot. Bardzo często, pliki z takimi rozszerzeniami wykorzystywane są jako pliki źródłowe danych wykorzystywanych przez SigmaPlot.
SigmaPlot może być wykorzystany do konwersji formatów plików, pomiędzy rozszerzeniami wymienionymi poniżej. Możesz otworzyć za pośrednictwem SigmaPlot plik posiadający jedno z poniższych rozszerzeń i spróbować zapisać go w innym rozszerzeniu, również obsługiwanym przez SigmaPlot.