Każde oprogramowanie domyślnie obsługuje wiele rozszerzeń plików. Spybot - Search & Destroy obsługuje co najmniej 6 różnych rozszerzeń plików. Podstawowe pliki, które wspiera Spybot - Search & Destroy to pliki .SBS. Nie zawsze wszysztkie wymienione na liście rozszerzenia wykorzysywane są jednak do zapisu efektów pracy w Spybot - Search & Destroy. Bardzo często, pliki z takimi rozszerzeniami wykorzystywane są jako pliki źródłowe danych wykorzystywanych przez Spybot - Search & Destroy.
Spybot - Search & Destroy może być wykorzystany do konwersji formatów plików, pomiędzy rozszerzeniami wymienionymi poniżej. Możesz otworzyć za pośrednictwem Spybot - Search & Destroy plik posiadający jedno z poniższych rozszerzeń i spróbować zapisać go w innym rozszerzeniu, również obsługiwanym przez Spybot - Search & Destroy.