Każde oprogramowanie domyślnie obsługuje wiele rozszerzeń plików. Star Trek: Armada obsługuje co najmniej 2 różnych rozszerzeń plików. Podstawowe pliki, które wspiera Star Trek: Armada to pliki .AID. Nie zawsze wszysztkie wymienione na liście rozszerzenia wykorzysywane są jednak do zapisu efektów pracy w Star Trek: Armada. Bardzo często, pliki z takimi rozszerzeniami wykorzystywane są jako pliki źródłowe danych wykorzystywanych przez Star Trek: Armada.
Star Trek: Armada może być wykorzystany do konwersji formatów plików, pomiędzy rozszerzeniami wymienionymi poniżej. Możesz otworzyć za pośrednictwem Star Trek: Armada plik posiadający jedno z poniższych rozszerzeń i spróbować zapisać go w innym rozszerzeniu, również obsługiwanym przez Star Trek: Armada.