Każde oprogramowanie domyślnie obsługuje wiele rozszerzeń plików. StarCraft II obsługuje co najmniej 17 różnych rozszerzeń plików. Podstawowe pliki, które wspiera StarCraft II to pliki .MFIL. Nie zawsze wszysztkie wymienione na liście rozszerzenia wykorzysywane są jednak do zapisu efektów pracy w StarCraft II. Bardzo często, pliki z takimi rozszerzeniami wykorzystywane są jako pliki źródłowe danych wykorzystywanych przez StarCraft II.
StarCraft II może być wykorzystany do konwersji formatów plików, pomiędzy rozszerzeniami wymienionymi poniżej. Możesz otworzyć za pośrednictwem StarCraft II plik posiadający jedno z poniższych rozszerzeń i spróbować zapisać go w innym rozszerzeniu, również obsługiwanym przez StarCraft II.