Każde oprogramowanie domyślnie obsługuje wiele rozszerzeń plików. Su3De obsługuje co najmniej 1 różnych rozszerzeń plików. Podstawowe pliki, które wspiera Su3De to pliki .SU3. Nie zawsze wszysztkie wymienione na liście rozszerzenia wykorzysywane są jednak do zapisu efektów pracy w Su3De. Bardzo często, pliki z takimi rozszerzeniami wykorzystywane są jako pliki źródłowe danych wykorzystywanych przez Su3De.
Su3De może być wykorzystany do konwersji formatów plików, pomiędzy rozszerzeniami wymienionymi poniżej. Możesz otworzyć za pośrednictwem Su3De plik posiadający jedno z poniższych rozszerzeń i spróbować zapisać go w innym rozszerzeniu, również obsługiwanym przez Su3De.