Każde oprogramowanie domyślnie obsługuje wiele rozszerzeń plików. UFO: Alien Invasion obsługuje co najmniej 1 różnych rozszerzeń plików. Podstawowe pliki, które wspiera UFO: Alien Invasion to pliki .DLLS. Nie zawsze wszysztkie wymienione na liście rozszerzenia wykorzysywane są jednak do zapisu efektów pracy w UFO: Alien Invasion. Bardzo często, pliki z takimi rozszerzeniami wykorzystywane są jako pliki źródłowe danych wykorzystywanych przez UFO: Alien Invasion.
UFO: Alien Invasion może być wykorzystany do konwersji formatów plików, pomiędzy rozszerzeniami wymienionymi poniżej. Możesz otworzyć za pośrednictwem UFO: Alien Invasion plik posiadający jedno z poniższych rozszerzeń i spróbować zapisać go w innym rozszerzeniu, również obsługiwanym przez UFO: Alien Invasion.