Każde oprogramowanie domyślnie obsługuje wiele rozszerzeń plików. Wii Unscrambler obsługuje co najmniej 1 różnych rozszerzeń plików. Podstawowe pliki, które wspiera Wii Unscrambler to pliki .WII. Nie zawsze wszysztkie wymienione na liście rozszerzenia wykorzysywane są jednak do zapisu efektów pracy w Wii Unscrambler. Bardzo często, pliki z takimi rozszerzeniami wykorzystywane są jako pliki źródłowe danych wykorzystywanych przez Wii Unscrambler.
Wii Unscrambler może być wykorzystany do konwersji formatów plików, pomiędzy rozszerzeniami wymienionymi poniżej. Możesz otworzyć za pośrednictwem Wii Unscrambler plik posiadający jedno z poniższych rozszerzeń i spróbować zapisać go w innym rozszerzeniu, również obsługiwanym przez Wii Unscrambler.