Każde oprogramowanie domyślnie obsługuje wiele rozszerzeń plików. Win96 obsługuje co najmniej 1 różnych rozszerzeń plików. Podstawowe pliki, które wspiera Win96 to pliki .P96. Nie zawsze wszysztkie wymienione na liście rozszerzenia wykorzysywane są jednak do zapisu efektów pracy w Win96. Bardzo często, pliki z takimi rozszerzeniami wykorzystywane są jako pliki źródłowe danych wykorzystywanych przez Win96.
Win96 może być wykorzystany do konwersji formatów plików, pomiędzy rozszerzeniami wymienionymi poniżej. Możesz otworzyć za pośrednictwem Win96 plik posiadający jedno z poniższych rozszerzeń i spróbować zapisać go w innym rozszerzeniu, również obsługiwanym przez Win96.