Każde oprogramowanie domyślnie obsługuje wiele rozszerzeń plików. WinJournal obsługuje co najmniej 1 różnych rozszerzeń plików. Podstawowe pliki, które wspiera WinJournal to pliki .WJE. Nie zawsze wszysztkie wymienione na liście rozszerzenia wykorzysywane są jednak do zapisu efektów pracy w WinJournal. Bardzo często, pliki z takimi rozszerzeniami wykorzystywane są jako pliki źródłowe danych wykorzystywanych przez WinJournal.
WinJournal może być wykorzystany do konwersji formatów plików, pomiędzy rozszerzeniami wymienionymi poniżej. Możesz otworzyć za pośrednictwem WinJournal plik posiadający jedno z poniższych rozszerzeń i spróbować zapisać go w innym rozszerzeniu, również obsługiwanym przez WinJournal.