Każde oprogramowanie domyślnie obsługuje wiele rozszerzeń plików. Yugioh Card Maker obsługuje co najmniej 1 różnych rozszerzeń plików. Podstawowe pliki, które wspiera Yugioh Card Maker to pliki .YCM. Nie zawsze wszysztkie wymienione na liście rozszerzenia wykorzysywane są jednak do zapisu efektów pracy w Yugioh Card Maker. Bardzo często, pliki z takimi rozszerzeniami wykorzystywane są jako pliki źródłowe danych wykorzystywanych przez Yugioh Card Maker.
Yugioh Card Maker może być wykorzystany do konwersji formatów plików, pomiędzy rozszerzeniami wymienionymi poniżej. Możesz otworzyć za pośrednictwem Yugioh Card Maker plik posiadający jedno z poniższych rozszerzeń i spróbować zapisać go w innym rozszerzeniu, również obsługiwanym przez Yugioh Card Maker.