Każde oprogramowanie domyślnie obsługuje wiele rozszerzeń plików. ISO Master obsługuje co najmniej 2 różnych rozszerzeń plików. Podstawowe pliki, które wspiera ISO Master to pliki .ISO. Nie zawsze wszysztkie wymienione na liście rozszerzenia wykorzysywane są jednak do zapisu efektów pracy w ISO Master. Bardzo często, pliki z takimi rozszerzeniami wykorzystywane są jako pliki źródłowe danych wykorzystywanych przez ISO Master.
ISO Master może być wykorzystany do konwersji formatów plików, pomiędzy rozszerzeniami wymienionymi poniżej. Możesz otworzyć za pośrednictwem ISO Master plik posiadający jedno z poniższych rozszerzeń i spróbować zapisać go w innym rozszerzeniu, również obsługiwanym przez ISO Master.