Każde oprogramowanie domyślnie obsługuje wiele rozszerzeń plików. WhatsApp Tri-Crypt obsługuje co najmniej 4 różnych rozszerzeń plików. Podstawowe pliki, które wspiera WhatsApp Tri-Crypt to pliki .CRYPT. Nie zawsze wszysztkie wymienione na liście rozszerzenia wykorzysywane są jednak do zapisu efektów pracy w WhatsApp Tri-Crypt. Bardzo często, pliki z takimi rozszerzeniami wykorzystywane są jako pliki źródłowe danych wykorzystywanych przez WhatsApp Tri-Crypt.
WhatsApp Tri-Crypt może być wykorzystany do konwersji formatów plików, pomiędzy rozszerzeniami wymienionymi poniżej. Możesz otworzyć za pośrednictwem WhatsApp Tri-Crypt plik posiadający jedno z poniższych rozszerzeń i spróbować zapisać go w innym rozszerzeniu, również obsługiwanym przez WhatsApp Tri-Crypt.