Każde oprogramowanie domyślnie obsługuje wiele rozszerzeń plików. Helium Music Manager obsługuje co najmniej 19 różnych rozszerzeń plików. Podstawowe pliki, które wspiera Helium Music Manager to pliki .FLAC. Nie zawsze wszysztkie wymienione na liście rozszerzenia wykorzysywane są jednak do zapisu efektów pracy w Helium Music Manager. Bardzo często, pliki z takimi rozszerzeniami wykorzystywane są jako pliki źródłowe danych wykorzystywanych przez Helium Music Manager.
Helium Music Manager może być wykorzystany do konwersji formatów plików, pomiędzy rozszerzeniami wymienionymi poniżej. Możesz otworzyć za pośrednictwem Helium Music Manager plik posiadający jedno z poniższych rozszerzeń i spróbować zapisać go w innym rozszerzeniu, również obsługiwanym przez Helium Music Manager.