Każde oprogramowanie domyślnie obsługuje wiele rozszerzeń plików. MediaMonkey obsługuje co najmniej 18 różnych rozszerzeń plików. Podstawowe pliki, które wspiera MediaMonkey to pliki .MP4. Nie zawsze wszysztkie wymienione na liście rozszerzenia wykorzysywane są jednak do zapisu efektów pracy w MediaMonkey. Bardzo często, pliki z takimi rozszerzeniami wykorzystywane są jako pliki źródłowe danych wykorzystywanych przez MediaMonkey.
MediaMonkey może być wykorzystany do konwersji formatów plików, pomiędzy rozszerzeniami wymienionymi poniżej. Możesz otworzyć za pośrednictwem MediaMonkey plik posiadający jedno z poniższych rozszerzeń i spróbować zapisać go w innym rozszerzeniu, również obsługiwanym przez MediaMonkey.